Ακτοπλοϊκές συγκοινωνίες

 Ο Άγιος Ευστράτιος συνδέεται ακτοπλοϊκά με τη Λήμνο όλες τις εργάσιμες ημέρες, με το Ε/Ο ΑΙΟΛΙΣ (αναχώρηση στις 06:30 από Άγιο Ευστράτιο και επιστροφή στις 15:00 από Μύρινα).
Με τη Νότια Ελλάδα συνδέεται 2 φορές την εβδομάδα με το λιμάνι του Λαυρίου (τηλ. πρακτορείου 2292026040).
Με τη Βόρεια Ελλάδα συνδέεται με 2 δρομολόγια την εβδομάδα με το λιμάνι της Καβάλας (τηλ. πρακτορείου 2510835671) και με το λιμάνι της Αλεξανδρούπολης (τηλ. πρακτορείου 2551023512).
Επειδή τα δρομολόγια αναθεωρούνται στο σύνολό τους τουλάχιστον δύο φορές κατ' έτος, πρέπει να φροντίσετε για έγκαιρη ενημέρωσή σας από τα πρακτορεία ή τα κατά τόπους λιμεναρχεία.

Μετακινήσεις μέσα στο νησί

 Το οδικό δίκτυο του νησιού αποτελείται από έναν ασφαλτοστρωμένο δρόμο μήκους 3χλμ. που συνδέει τον οικισμό με το ύψωμα του Προφήτη Ηλία και ένα δίκτυο βατών χωματόδρομων που επιτρέπουν την πρόσβαση σε ολόκληρο σχεδόν το νησί. Στον οικισμό θα βρείτε βενζινάδικο και ενοικιαζόμενα μοτοποδήλατα και αυτοκίνητα (τηλ. 2254093288).
Ο κεντρικός δρόμος που παρέχει πρόσβαση προς το νότιο τμήμα του νησιού ξεκινά  500 μέτρα πριν το τέλος του ασφάλτινου δρόμου, έχει συνολικό μήκος 10χλμ. και φτάνει μέχρι το μνημείο προς τιμήν του πιλότου της Π.Α. Νικολάου Σιαλμά στο ακρωτήριο Τρυπητή. Κατά μήκος του υπάρχουν σημασμένες διασταυρώσεις που οδηγούν στις δυτικές παραλίες του νησιού.
Λίγα μέτρα μετά τη διασταύρωση με τον κεντρικό χωματόδρομο υπάρχει μία επιπλέον διασταύρωση που οδηγεί στο εξωκκλήσι και την παραλία του Αγίου Αντωνίου.
Ένα δεύτερο δίκτυο χωματόδρομων προσφέρει πρόσβαση στο βόρειο και ανατολικό τμήμα του νησιού.
Κινούμενοι βόρεια από τον οικισμό και πριν φτάσουμε στο ελικοδρόμιο στα δεξιά μας συναντάμε μία διασταύρωση που οδηγεί στο βόρειο τμήμα του νησιού (Αυλάκια) και κατόπιν στρίβει δυτικά και καταλήγει στο εξωκκλήσι του Αη Γιώργη.
Τέλος, αν με αφετηρία το λιμάνι κινηθούμε παράλληλα προς το ποτάμι και διαβούμε το μικρό κίτρινο γεφυράκι θα βρούμε το χωματόδρομο που μας οδηγεί στη βορειοανατολική πλευρά του νησιού στην παραλία Αλονίτσι. Πολύ κοντά στον οικισμό θα συναντήσουμε μία διασταύρωση που οδηγεί προς τα εξωκκλήσια της Μικρής και Μεγάλης Παναγιάς και μία δεύτερη διασταύρωση που οδηγεί στο λόφο του Αη Μηνά.